卵巢囊肿是比较常见的，在许多情况下不体现任何症状，也常常被忽略，或是不用处理。 然而，如果囊肿大或增加症状，这种情况下可能需要外科来去除。
卵巢囊肿主要分为两大类，一类属功能性，第二类属非功能性，即肿物，肿物再分为良性、非良性，中间还有一种交界性肿物。一类功能性卵巢囊肿，属生理性，每个月经周期随着卵子长大，在排卵前差不多有两厘米大，如这时照超声波见到两厘米的泡，很大机会是功能性的。
卵巢囊肿的原因
常见的囊肿叫功能性囊肿，它是发育中的卵细胞周围聚集液体形成的，每个月在排卵时会有少量的液体围绕在发育中的卵细胞，卵细胞和制造液体的细胞以及液体合起来就是滤泡，大小像豌豆一样，有时围绕在卵细胞周围的细胞偶尔会制造过量的液体，稻草色的液体使卵巢从内部膨胀，若液体的积聚使滤泡超过正常的大小，则称为滤泡性囊肿，若液体持续堆积，卵巢就像充水的气球般鼓起，使卵巢正常白色的上皮会变得很薄很平滑同时出现蓝灰色的样子。
滤泡性囊肿很少太大，大多数囊肿常一到两个月会消失，液体会回流到血液中。排卵时卵巢上皮会破裂释放卵细胞，在几个小时内破裂处会愈合，卵巢细胞会形成黄体并制造黄体内分泌让子宫内膜准备受精卵的到达，妇女每个月都会形成黄体也都有细胞制造一些液体形成黄体囊肿，它很少超过一个弹珠的大小，但也有少数超过几英吋，它和滤泡囊肿一样差不多都会在几周内消失，滤泡囊肿和黄体囊肿都属于功能性囊肿。
女性排卵后，会形成(目的在维持子宫内膜的稳定)，这类功能性的卵巢囊肿，在一两个月经周期后会消失，毋须特别处理。第二类的非功能性肿物，如属良性瘤，并不会侵蚀附近器官，亦不会转移到身体其他地方，手术切除。
良性肿物有不同类别，常见有黏液性肿物、浆液性肿物、畸胎瘤(含头发、牙齿、脂肪、骨等组织)。性质较为严重的肿物，有能力侵蚀附近器官、组织，亦有机会经血液、经淋巴扩散至其他部位。卵巢位于盆腔内，而腹腔与盆腔是相通的，故非良性的细胞有机会从卵巢表面，沿盆腔走至腹腔，然后在腹腔内扩散。
第三类交界性肿物，一样可以侵蚀附近器官，一样会扩散，但其生长速度较慢，扩散或侵蚀机会较低，因临牀特性加上病理特性不同亦得出此类。
卵巢囊肿并发症的疼痛
小部分因囊肿压住附近组织或器官而产微征状。如出现腹痛，则无论良性、恶性或是功能性肿物，都可以判断出已经出了并发。常见的并发有穿破，里面的液体流入盆腔，致腹膜产生剧痛。
