睾丸异常性会使产生的精子发生变化，从而直接的影响到男性的生育，而引起不育疾病的发生。另外，睾丸一个重要的功能是分泌男性荷尔蒙。如果是睾丸炎引起的精子质量异常，是可以通过治疗。但是无睾症，隐睾症等这类疾病引起的睾丸不育，要另外对待。
睾丸炎（Orchitis）通常由细菌和病毒引起。睾丸本身很少发生细菌性感染，由于睾丸有丰富的血液和淋巴液供应，对细菌感染的抵抗力较强。细菌性睾丸炎大多数是由于邻近的附睾发炎引起，所以又称为附睾一睾丸炎。病毒可以直接侵犯睾丸。
隐睾病，正常情况下，胎儿在子官内发育的后期，睾丸即降入阴囊内。然而，一部分早产男婴发生隐睾（睾丸未降）。这些婴儿中的大多数，在出生后数月内睾丸方可降入阴囊。隐睾的治疗主要包括内分泌治疗和手术治疗两方面。
异位睾丸，睾丸从腹股沟管下降时，可能并未降入阴囊内的正常位置，而引引起异位睾丸。异位睾丸很少见，它的临床意义及治疗原则一般与隐睾相同。
无睾先天性双侧无睾，少见，其病因可能是：胎儿性别分化后，胎儿睾丸被某种毒素所破坏。
多睾系指睾丸数目大于2个，一般认为不大于3个睾丸，左侧多于右侧。多余的睾丸很少能正常发育，长期异位存在并萎缩的睾丸有发生病变的可能，因此应将多余的睾丸尽早手术切除。
并睾系指两侧睾丸融合一体，可发生于阴囊内，亦有在腹腔内。并睾常伴有其他严重先天畸形。
睾丸发育不全，胚胎时期由于血液供应障碍或于睾丸下降时发生精索扭转 精索扭转，可引起本病。
睾丸增生，睾丸增生是指睾丸较正常大，而其硬度及局部解剖关系均正常，常见于一侧睾丸缺如或发育不全时，对侧睾丸代偿性增生。
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